A manjerona tem grande reputação como erva medicinal. Foi muito usada pelos antigos gregos na medicina, perfumes e outros artigos de toucador. Eles a usavam como remédio para convulsões, hidropisia e envenenamento por narcóticos. Assim como o manjericão, a manjerona tem um odor mais refinado do que a maioria dos óleos essenciais extraídos das labiatas. Mistura-se bem com lavanda e bergamota, e os três juntos produzem uma mistura relaxante e muito agradável. Seu gosto é extremamente amargo, e aquece o coração e o estômago. A manjerona produz um óleo de banho relaxante, quente e fortalecedor.
O óleo de manjerona esquenta, alivia o espasmo, ajuda a digestão e a menstruação e abaixa a pressão alta. A maioria de suas funções se centraliza em torno da ação do sistema nervoso autônomo. Seus efeitos antiespasmódico-sedativo-aquecedor fazem dele um utilíssimo ingrediente de óleos de massagem para aplicação geral. A manjerona é muito boa para as condições vindas da dor, e tem um efeito especialmente aquecedor e confortador para o coração, dando-lhe repouso. A manjerona também é boa para espasmos musculares, dores reumáticas, torceduras, entorses e outros mais. Ela ajuda a desfazer contusões. Em resfriados, pode ser usada em inalações ou massageada sobre a área sinusal e das têmporas. Em dores de cabeça e enxaqueca, pode ser tomada internamente. Como aquecedora emenagoga, pode ser usada em duchas vaginais, sendo boa para leucorreia e dores periódicas. A manjerona é um bom remédio para impulsos sexuais excessivos. Ela pode ser usada no caso de orgasmo noturno, masturbação obsessiva, ninfomania, etc, especialmente quando associada com histeria ou ansiedade.
A manjerona age como laxante, estimulando e fortalecendo o movimento peristáltico intestinal; isso também se relaciona com sua ação digestiva e carminativa. Ao mesmo tempo, alivia o espasmo intestinal, sendo portanto útil para cólicas, flatulências e indigestão. Sua ação sobre o sistema nervoso é sedativa e tônica. Ela é eficaz para insônia e estados de ansiedade, especialmente quando há pressão alta.